液相色譜和氣相色譜的主要相同點在于它們都是色譜法，具有分離和分析的功能，并且都可以進行在線檢測。
然而，它們的主要差異在于它們的應(yīng)用范圍和分析對象。液相色譜法不受樣品揮發(fā)性和熱穩(wěn)定性的限制，只要求把樣品制成溶液即可，非常適合于分離生物大分子、離子型化合物、不穩(wěn)定的天然產(chǎn)物以及其他各種高分子化合物等。而氣相色譜法主要用于分離氣體樣品或者容易揮發(fā)的物質(zhì)。
另外，液相色譜和氣相色譜所使用的儀器和原理也有所不同。液相色譜儀由高壓輸液系統(tǒng)、進樣系統(tǒng)、分離系統(tǒng)、檢測系統(tǒng)、數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)組成，主要采用高壓輸液泵、固定相、梯度洗脫技術(shù)和高靈敏度檢測器。而氣相色譜儀則主要由分離系統(tǒng)、檢測系統(tǒng)、數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)組成，采用惰性氣體作為流動相。
